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Reproductibility
Commits
b00b4d0f
Commit
b00b4d0f
authored
4 years ago
by
Celine Noirot
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4212297c
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Pipeline
#21165
passed
4 years ago
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1
Pipelines
1
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Side-by-side
Showing
1 changed file
nextflow/README.md
+5
-4
5 additions, 4 deletions
nextflow/README.md
with
5 additions
and
4 deletions
nextflow/README.md
+
5
−
4
View file @
b00b4d0f
...
...
@@ -29,7 +29,7 @@ lors du hackathon.
sh /usr/local/bioinfo/src/NextflowWorkflows/create_nfx_dirs.sh
```
*
Aller dans le work (espace de travail acc
é
sible depuis les noeuds en lecture/écriture)
*
Aller dans le work (espace de travail acc
es
sible depuis les noeuds en lecture/écriture)
```
cd ~/work
```
...
...
@@ -41,7 +41,9 @@ lors du hackathon.
*
Suivre les instructions à partir de la partie 2: https://seqera.io/training/
Quelques vidéos du hackathon nextflow de juillet 2020 du CRG:
Voici des liens vers les vidéos du hackathon nextflow de juillet 2020 du CRG.
En suivant le tuto vous pourez voir les tranches de temps correspondant aux différents points abordés.
*
Day 1 : https://www.youtube.com/watch?v=8_i8Tn335X0 point important pointé ci-dessous :
*
Concept de base 20mn-28mn
*
Portabilité & Conteneurisation: 33m-38m
...
...
@@ -71,7 +73,7 @@ Quelques vidéos du hackathon nextflow de juillet 2020 du CRG:
*
01:04:24 4.2-Inputs
*
01:07:46 Inputs files
_
*
01:10:00 erreur fichier input.1 est créé sans que je l'ai demandé_
_
*
01:18:31 path (converti automatiquement un string en file channel )_
_
*
01:18:31 path (converti
s
automatiquement un string en file channel )_
*
01:21:15 Combine input channels
*
01:32:00 Input repeaters
*
01:36:30 Outputs
...
...
@@ -100,6 +102,5 @@ Quelques vidéos du hackathon nextflow de juillet 2020 du CRG:
*
56min: conda
*
1h05: configuration
*
Day 5 : https://www.youtube.com/watch?v=IcMz6JE8n_M
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