add short data

README.md

@@ -43,7 +43,7 @@ singularity pull template-nf.sif oras://registry.forgemia.inra.fr/get-nextflow-n
 - pour le reproductibilité : `Singularityfile` et `environment.yml` (si besoin en plus: `Dockerfile`)
 
 ## Et apres ?
-
+- nomenclature: les channels doivent etre nommée comme suis: ch_FILE1_for_PROCESS_DESTINATION
 - mettre en place des données de tests
 - lorsque l'on code un process : 
     - utiliser les labels (pour la memoire, cpu, temps) définis dans base.config
@@ -52,7 +52,9 @@ singularity pull template-nf.sif oras://registry.forgemia.inra.fr/get-nextflow-n
 - completer le `doc/output.md` et le `doc/usage.md`
 - tagger un pipeline dès que les fonctionnalités attendues sont codées
 
-# Documentation a completer pour les pipelines suivants :
+
+
+> La documentation suivante est a modifier et a garder. La precedente est a supprimer. 
 
 ## Introduction
 

data/samples.csv

+1,MT,./data/MT_rep1_1_Ch6.fastq.gz,./data/MT_rep1_2_Ch6.fastq.gz
\ No newline at end of file