Documentation

Ajouter dans le README :

• 0.5 CPM filtrage contigs (format paramètre nombre de CPM si nombre décimal).
• configuration prokka : si l'utlisateur skippe l'étape de filtrage des contigs, dire à l'utilisateur d'ajouter dans un fichier nextflow.config dans le répertoire de lancement de son script nextflow : withName: prokka { queue = 'unlimitq' }